Zhang Xudong 23bca60cc5 update | %!s(int64=2) %!d(string=hai) anos | |
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example_data | %!s(int64=2) %!d(string=hai) anos | |
README.md | %!s(int64=2) %!d(string=hai) anos | |
cog_funclass.tab | %!s(int64=3) %!d(string=hai) anos | |
emapperx.R | %!s(int64=3) %!d(string=hai) anos | |
install.R | %!s(int64=3) %!d(string=hai) anos | |
kegg_info.RData | %!s(int64=3) %!d(string=hai) anos |
git clone http://git.genek.cn:3333/zhxd2/emcp.git
输入文件为蛋白序列, 参考 example_data 目录下的 proteins.fa
登录 http://eggnog-mapper.embl.de/ 上传蛋白序列, 在线进行蛋白注释.
完成后下载 out.emapper.annotations
以测试数据为例
cd example_data
Rscript ../emapperx.R out.emapper.annotations proteins.fa
这一步两个功能: