Zhang Xudong 23bca60cc5 update | před 2 roky | |
---|---|---|
example_data | před 2 roky | |
README.md | před 2 roky | |
cog_funclass.tab | před 3 roky | |
emapperx.R | před 3 roky | |
install.R | před 3 roky | |
kegg_info.RData | před 3 roky |
git clone http://git.genek.cn:3333/zhxd2/emcp.git
输入文件为蛋白序列, 参考 example_data 目录下的 proteins.fa
登录 http://eggnog-mapper.embl.de/ 上传蛋白序列, 在线进行蛋白注释.
完成后下载 out.emapper.annotations
以测试数据为例
cd example_data
Rscript ../emapperx.R out.emapper.annotations proteins.fa
这一步两个功能: