 Stephen Ficklin
|
0b0d4e1f49
Removed the old cvterm.php file as those API functions have been replaced. All call to those old functions have been removed
|
před 12 roky |
|
spficklin
|
af2ff151e6
Moved most extensions out. Moved base modules out of 'base' directory
|
před 13 roky |
 alexgl
|
c5d67e59c6
moving more modules into base and extensions respectively
|
před 13 roky |
|
spficklin
|
10b5f36a72
|
před 13 roky |
|
spficklin
|
64d5b96f29
Fixed the tripal core to allow inclusion of 'NULL' values in inserts and updates. Also, added support for 'Gap', 'Target', and 'Derives_from' attributes in the GFF3 file.
|
před 13 roky |
|
spficklin
|
72355c4080
Fixed a few bugs in the GFF loader, sped up insertions and added the 'score' column of the GFF file to the 'significance' column of the featureanalysis
|
před 13 roky |
|
spficklin
|
95e1b150fc
Fixed multiple things including the following
|
před 13 roky |
|
spficklin
|
41ca848a92
Fixing mistake in subtracting 1 from fmax in featureloc entries
|
před 13 roky |
|
spficklin
|
54302f6010
Fixed indexing of featurelocs. When importing a GFF file they should be zero-based and must subtract 1. The feature theming has been updated to add 1 back.
|
před 13 roky |
|
spficklin
|
5fdf1f2b6f
Added a very simple GAF 2.0 loader for loading GO terms (specifically for Blast2GO)
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
bcf56a9189
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
94ef4739bb
Fixes to templates and update to GFF3 loader
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
6e62c48178
Added support for GBrowse Chado adaptor in GFF loader
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
d8567d8967
updates to blast, core, gff loader, etc... fixed several bugs
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
05d50175b0
|
před 14 roky |
 laceysanderson
|
243942d0b3
Added documentation changes
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
b172b7459a
Fixed bug in gff loader, and added 'cancel' and 're-run' actions to the jobs page
|
před 14 roky |
|
laceysanderson
|
26939a277a
Added to documentation of tripal_feature using doxygen standards
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
c616bca1ea
Add analysis requirement to GFF loader
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
bc06d86bf6
Various bug fixes and themeing issues
|
před 14 roky |
|
laceysanderson
|
1c59d38e68
Re-arranged feature admin menu including adding the feature module description stub and moving the gff loader from core to feature
|
před 14 roky |
