 Lacey Sanderson
|
fca91cc322
Added more doxygen commenting -there wasn't any groups for the bulk loader or tripal views
|
před 12 roky |
 spficklin
|
7547efd269
Changed directory structure of organism module to match the others. Added an admin.inc and a new theme directory and an api directory.
|
před 12 roky |
|
spficklin
|
128443c86a
Cleaned up featuremap module. Added unittype_id to form and created cvterms for the unit types
|
před 12 roky |
|
spficklin
|
9bb94c3748
Fixed issue #1699022. Took out all code that tried to distinguish a revision.
|
před 12 roky |
|
spficklin
|
42fe28540f
Fixed issue #1712422. Changed all Chado querie to use chado_query() rather than db_query()
|
před 12 roky |
|
spficklin
|
2fd046eebd
Forgot tripal_organism_teaser in theme
|
před 12 roky |
|
spficklin
|
cd87d5a56a
Fixed Drupal formatting standards
|
před 12 roky |
|
Stephen Ficklin
|
a28f785f25
Had to rollback a fix that removed memory leaks, but it casued other problems
|
před 12 roky |
|
spficklin
|
2840b98e85
All node types (except stock) have a function to cleanup orphaned nodes but it wasn't complete for some. A new core API function was created that all modules with node types can use to clean up orphaned nodes. Also, the drush trpjob-run command was fixed so that a username must be provided to run the job
|
před 12 roky |
|
spficklin
|
c324a8440f
Merged in 6.x-6233304-Support_for_Chado_v1.2 branch and removed non-views stocks page
|
před 12 roky |
|
spficklin
|
06ed7b835c
Removed old organism and analyses lists as this duplicates are default views and views is easy enough to install if someone wants the list
|
před 12 roky |
|
spficklin
|
bc6d1b4c41
Fixed revisions in update
|
před 12 roky |
|
Stephen Ficklin
|
1dae1ea23a
Revisions weren't working properly for organisms. Fixed it
|
před 12 roky |
 Pubudu Basnayaka
|
aaed62d7f5
Tripal Organism adheres to Drupal coding standards
|
před 12 roky |
|
Pubudu Basnayaka
|
e6e051e53d
Tripal Organism now adhere to Drupal coding standards
|
před 12 roky |
|
spficklin
|
af2ff151e6
Moved most extensions out. Moved base modules out of 'base' directory
|
před 13 roky |
 alexgl
|
c5d67e59c6
moving more modules into base and extensions respectively
|
před 13 roky |
|
spficklin
|
fb76301d42
Fixed hook_access for all modules. This change supports use of other access permission modules, such as "node privacy by role"
|
před 13 roky |
 ccheng
|
9e1584f598
Update permission checks
|
před 13 roky |
|
ccheng
|
047eb8a0e8
|
před 13 roky |
|
spficklin
|
95e1b150fc
Fixed multiple things including the following
|
před 13 roky |
|
spficklin
|
f3f1671a51
Fixed a bug in the organism module where it wouldn't sync the organism
|
před 13 roky |
 laceysanderson
|
e0500f0746
Tripal: Added documentation
|
před 13 roky |
|
spficklin
|
b90ea5955d
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
0dd8d23333
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
94ef4739bb
Fixes to templates and update to GFF3 loader
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
740bec5016
Various bug fixes and theming adjustments
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
5ac6843b37
Fixed bugs and some themeing, and added support for parsing query matches in the blast analysis.
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
eff151490d
More work on theming for analysis go, organism and feature
|
před 14 roky |
|
spficklin
|
bcb9dedeb5
Continued fixes to the theming
|
před 14 roky |
