 Risharde Ramnath
|
da939901ea
Fixed ID regular expression check in GFF loader, added new test for invalid start end values and corresponding test gff file
|
4 ani în urmă |
|
Risharde Ramnath
|
49651d6c8a
Better ID validation check within the GFF3 loader
|
4 ani în urmă |
|
Risharde Ramnath
|
fefe37536c
Minor fix regarding whitespace detection in GFF3 importer ID validation
|
4 ani în urmă |
|
Risharde Ramnath
|
5e98649061
2 additional unit tests and corresponding gff files related to ID validations for unescaped whitespaces and IDs beginning with right arrow character
|
4 ani în urmă |
 Stephen Ficklin
|
37c37a002e
Merge pull request #1123 from risharde/1040-tv3-gff3_performance
|
4 ani în urmă |
|
Stephen Ficklin
|
3b2de6fd43
Fixed merge conflict
|
4 ani în urmă |
|
Risharde Ramnath
|
baa68f391c
All unit tests now pass, added additional gff files for tests, modified a few functions to correctly do tests, removed dependency on remote files in favour of local files in the data directory for tests.
|
4 ani în urmă |
|
Stephen Ficklin
|
66e1e7c857
Merge pull request #1121 from katherynbuble/patch-1
|
4 ani în urmă |
 katherynbuble
|
cc18cb55ca
Update visualization.rst
|
4 ani în urmă |
|
katherynbuble
|
2dafd2ea4e
Update in_development.rst
|
4 ani în urmă |
|
Stephen Ficklin
|
260bae3b63
Fixed bugs in issue #1118
|
4 ani în urmă |
|
Stephen Ficklin
|
10c5b7d4cc
another update to comment
|
4 ani în urmă |
|
Stephen Ficklin
|
bd50a96563
update to comment
|
4 ani în urmă |
|
Stephen Ficklin
|
ad07ca84cc
Fix for bug with db names containing slashes
|
4 ani în urmă |
|
Stephen Ficklin
|
7c29399037
Fixed for issue #1116
|
4 ani în urmă |
 Lacey-Anne Sanderson
|
493e4a77bf
Merge pull request #1113 from tripal/1112-tv3-web_services_field_entity
|
4 ani în urmă |
|
Stephen Ficklin
|
120fa5b96c
Added fix for issue #1112
|
4 ani în urmă |
|
Stephen Ficklin
|
565f1e93f2
Merge pull request #1109 from dsenalik/20201016chado_linker__prop_formatter
|
4 ani în urmă |
 dsenalik
|
b99e23f369
Tripal field URLs made clickable v.2
|
4 ani în urmă |
|
Stephen Ficklin
|
f1f63dafc6
Merge pull request #1106 from risharde/1040-tv3-gff3_performance
|
4 ani în urmă |
|
dsenalik
|
10f0c0981f
Tripal field URLs made clickable
|
4 ani în urmă |
|
Stephen Ficklin
|
b8c1c67904
Merge pull request #1107 from dsenalik/tripaltypos20201015
|
4 ani în urmă |
|
dsenalik
|
70e4b3c7c4
October corrections for typos
|
4 ani în urmă |
|
Lacey-Anne Sanderson
|
8eab8f85ab
Merge pull request #1105 from tripal/1100-tv3-references_field
|
4 ani în urmă |
|
Lacey-Anne Sanderson
|
137b499a1c
Merge pull request #1095 from dsenalik/chado.organism.api20201004
|
4 ani în urmă |
|
Lacey-Anne Sanderson
|
0799c1a905
Merge pull request #1090 from tripal/1089-tv3-field_alter_hooks
|
4 ani în urmă |
|
Lacey-Anne Sanderson
|
38fecb4470
Merge pull request #1087 from dsenalik/oboimporter20201001
|
4 ani în urmă |
|
Risharde Ramnath
|
b2c0291cb4
Fixed testGFFImporterAttributeFastas() test, assertion values were based on the wrong file. Updated with the correct string lengths and md5 values
|
4 ani în urmă |
|
Risharde Ramnath
|
5f4d0f8b6a
Removed additional gap from small_gene.gff since only one gap variable is allowed per gene. Fixed the test to only look for one gap - test public function testGFFImporterAttributeProperty() {completes correctly
|
4 ani în urmă |
|
Stephen Ficklin
|
8b0cfedbe4
Added check for Gap in the GFF
|
4 ani în urmă |
