 Stephen Ficklin
|
213f35c56d
Fixed issue #533
|
před 6 roky |
|
Stephen Ficklin
|
3e49cbd827
Merge branch '7.x-3.x' into fix-tv3-rc3_pre_release
|
před 6 roky |
|
Stephen Ficklin
|
0ca00c8031
Fixed a bug where ontologies loading during preparing don't get the cvtermpath updated and a field being added for the pub.pub_id field (same problem as the analysis fix previously committed
|
před 6 roky |
|
Stephen Ficklin
|
70c112eb68
Fixed warning about missing 'short_name' after fresh install
|
před 6 roky |
|
Stephen Ficklin
|
1ef659f361
Added some output to help when upgrading a large tripal site. Preparing Chado can take a while
|
před 6 roky |
|
Stephen Ficklin
|
8998ca476f
Removed unwanted comma in SQL
|
před 6 roky |
|
Stephen Ficklin
|
787958a55c
Because the prepare is now required for Tripal v2->v3 upgrade I have updated the prepare instructions and removed the skip button
|
před 6 roky |
 Shawna Spoor
|
9096723c9a
found deprecated terms that needed to be swapped out
|
před 6 roky |
|
Shawna Spoor
|
d4ccef15fc
changes to bring the tripal chado api module files into naming standards setout in ticket 330
|
před 6 roky |
 Lacey Sanderson
|
6995d06345
Bug Fix: Better error message during prepare chado when fail creating content type.
|
před 6 roky |
 Lacey Sanderson
|
b305ab18f8
Chado Prepare Bug: Create Custom table tries to redirect which fails with Drush
|
před 6 roky |
|
Stephen Ficklin
|
54e848aee5
Clean-ed up the cv/lookup and added a simple tree browser that could use some improvement
|
před 6 roky |
|
Stephen Ficklin
|
d9e87077f6
Added support for Phylogenetic Tree content type and visualization field
|
před 7 roky |
 Anthony Bretaudeau
|
d15eb0b2c9
various fixes
|
před 7 roky |
|
Stephen Ficklin
|
7dd9325d6a
Merge remote-tracking branch 'origin/7.x-3.x-installprofile' into 7.x-3.x
|
před 7 roky |
|
Stephen Ficklin
|
f853f19cb6
Changed Analysis content type to use operation:2945 term. issue #151
|
před 7 roky |
|
Shawna Spoor
|
1553ac902d
new drush command for installing tripal
|
před 7 roky |
|
Stephen Ficklin
|
6b78d9da21
Added biological sample entity type
|
před 7 roky |
|
Lacey Sanderson
|
baaa1a4cbd
Small fixes related to progress reporting for publishing entities.
|
před 7 roky |
|
Lacey Sanderson
|
547834a78a
Fix to prepare chado which allows the function to be run outside of a Tripal Job.
|
před 7 roky |
|
Lacey Sanderson
|
4cbf24071e
Ensured that all completed jobs show 100% progress and added arbitrary progress reporting to the Prepare Chado job.
|
před 7 roky |
|
Stephen Ficklin
|
841169aa5e
Removed unneeded include when launching prepare job
|
před 7 roky |
|
Lacey Sanderson
|
f9644f2513
Bug Fix during Chado Prepare: unable to look up dbxref due to vocab and accession not being included in the instance details.
|
před 7 roky |
 Chun-Huai Cheng
|
3ac80ad0d6
Added missing chado_cvterm_mapping for Map and Publication entity types
|
před 7 roky |
|
Lacey Sanderson
|
4c8f762c15
Prepare Chado: Quick Type fix.
|
před 7 roky |
|
Stephen Ficklin
|
0290450c32
Fix to tripal.install and to Chado prepare function
|
před 7 roky |
|
Stephen Ficklin
|
0018be0880
Updated TripalImporter
|
před 7 roky |
|
Stephen Ficklin
|
74cfacc807
Added upload file permission
|
před 7 roky |
|
Stephen Ficklin
|
01b134e1bf
Fixed bug in setup/prepare step
|
před 7 roky |
|
Stephen Ficklin
|
90bd7cd4e7
Finishgin up TripalJob and TripalImporter classes'
|
před 7 roky |
