 Jiu9Shen
|
95e9353c39
fix issue of vcf files not copied to right sub-dir
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
593e936771
fix issue realted to creating symlink, also make it selected as default
|
před 5 roky |
 Lacey Sanderson
|
c5045a0ccc
Ensure bam/cram submits and job adds it to JBrowse.
|
před 5 roky |
|
Lacey Sanderson
|
dd009f397d
Ensure directory/index are shown for bam/cram.
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
b0d5e7eeb8
change file validate/upload of folder to a function
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
a60cf92b85
include new file type and track type in track file.
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
2a460cd39c
include alignment tracks bam and cram in commands
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
3d87a19701
allow multiple tracks with same file by selecting Symbolic Link, also update warning messages
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
1bfb386d40
fix issue related to instance links, tested on local, need more tests
|
před 5 roky |
 Lacey-Anne Sanderson
|
d3834a31b4
Merge pull request #43 from Jiu9Shen/35-multiple_jbrowses_41organism
|
před 5 roky |
|
Lacey-Anne Sanderson
|
0ae800693d
Merge pull request #44 from Jiu9Shen/40-textfileld_maxlength_change
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
c67c594b61
Merge branch '7.x-3.x' into 35-multiple_jbrowses_41organism
|
před 5 roky |
|
Lacey-Anne Sanderson
|
c07d84f304
Merge pull request #41 from Jiu9Shen/38-track_manage_edit_json
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
705f91f2dd
fix issues(move file to wrong dest and wrong label in json) related to bigwig track creation
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
af944f8ce9
ready for more tests on more sites
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
d04f147763
fixed issues of cannot find right path for tracks. Need more tests.
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
c68fa8b843
track key or lable change is checked in form validation now, give warning if there is change
|
před 5 roky |
|
Yichao Shen
|
06fad0df82
Update tripal_jbrowse_mgmt/includes/tripal_jbrowse_mgmt_tracks.form.inc
|
před 5 roky |
|
Yichao Shen
|
d096917b42
Update tripal_jbrowse_mgmt/includes/tripal_jbrowse_mgmt_tracks.form.inc
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
b32a76f047
fix a bug related to track key/label
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
6dda51be4e
add maxlength = 255 to several textfields
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
2a9d7cfa29
change instruction message
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
a17591b196
delete test lines, should be ready for review.
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
fcef351b97
json editor of whole configuration of a track works, need more tests
|
před 5 roky |
|
Lacey-Anne Sanderson
|
43dee33963
Merge pull request #37 from Jiu9Shen/34-modify_add_vcf_track
|
před 5 roky |
|
Yichao Shen
|
5576c1c88f
Update tripal_jbrowse_mgmt/includes/tripal_jbrowse_mgmt_tracks.form.inc
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
caf79b9f9d
Delete test lines, also fix the issue of can not delete vcf track from json file.
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
f48d5889c1
Include csi and idx index formats for vcf tracks.
|
před 5 roky |
|
Jiu9Shen
|
8ddc57f761
add option of Symbolic Link for Track File upload for Management. Functionality has tested on local drupal site.
|
před 5 roky |
 Abdullah Almsaeed
|
88ba171f61
Add a base path for the tracks data dir
|
před 6 roky |
